有的关系是显而易见的，比如从生物分类学上看，人类属于脊椎动物亚门下的哺乳纲中的灵长目动物；而有的关系却非常微妙，识别它们的过程面临着许多天然的、固有的、难以绕开的困难。
有这样一个与脊椎动物有关的问题最重痕迹原味内内，它原本应该是微妙的、困难的、需要更多讨论的，但有趣的是人们从很久以前就对其达成了共识，这个问题便是——脊椎动物的最近亲缘究竟为何。1908年，奥地利动物学家Karl Grobben首次提出，与我们亲缘关系最近的非脊椎动物，是一个与脊椎动物没有任何重大相似之处的群体——棘皮动物（如海星、海参、海胆等）。自那时候起，这一观点便被广泛接受。
现在，一篇发表于《科学进展》上的新研究对这种观点进行了反驳，认为被宣扬了一个多世纪的脊椎动物和棘皮动物之间的密切关系——是错误的。新研究表明，判断究竟是什么拥有与脊椎动物相近的亲缘关系，是一个极难解决的进化问题。
调查结果发现，约70%的原口动物拥有比后口动物更多的独有的DNA序列变化，这意味着原口动物这一分支上的动物的DNA序列有着更多的共有变化。也就是说，原口动物这一分支更好地得到了DNA证据的支持；而相比之下支持后口动物这一分支的证据则薄弱了许多，从DNA序列变化数量来看，脊椎动物和棘皮动物之间所共有的独特DNA变化相对较少，因此它们的亲缘关系很可能不如我们以为的那么密切。
接着，他们将脊椎动物、棘皮动物和原口动物在进化树中进行了不同的排列。第一棵进化树（后口树）就是被广泛接受的经典场景，人类为代表的脊椎动物与海星为代表的的棘皮动物有着密切的亲缘关系，都属于后口动物，以蜗牛为代表的的无脊椎动物为原口动物；第二棵进化树则是将棘皮动物和原口动物归为有着密切亲缘关系的一类，脊椎动物属于另一类；第三棵进化树将脊椎动物和原口动物归为一类，棘皮动物另属一类。
结果表明，对于许多基因来说，并没有出现大量的DNA变化足以支持这三种场景中的任何一种。而对于那些能得出明显倾向于其中的某一种场景的基因来说，被广为接受的后口进化树只在非常少的情况下，才得到了强于另外两种进化树的证据的支持。
这样的结果意味着，脊椎动物、棘皮动物、原口动物，是三个在很短时间内分开的分支，因此它们没有足够的时间在DNA中积累很多变化。也就是说，对于现在的研究人员而言，已经很难分辨出三种进化树究竟其中哪一种才是正确的。从研究结果来看，后口进化树与另外两种几乎没有什么区别。
